日本京都是西日本的“學都”，在京阪神地區更有“在京都上學、在大阪賺錢、在神戶生活”這樣的說法，可見日本京都教育的發達程度。那日本京都有哪些大學？

1886年日本第二個帝國大學—京都帝國大學即設在京都。同時民間相繼創辦了眾多私立大學。日本京都的大學中，歷史最悠久且學術地位最高的是京都大學。而在私立大學中，以同志社大學和立命館大學規模最大。

除了上述三所大學之外，日本京都市的主要大學還有京都產業大學、龍谷大學、佛教大學、京都女子大學、大谷大學、花園大學、京都造形藝術大學、京都精華大學、京都外國語大學、京都教育大學、京都府立大學、京都府立醫科大學等。

1994年，京都市成立了京都大學中心（現改名為京都大學聯盟），其目的是促進各大學之間的合作，加盟大學的學生可聽講其他加盟學校的科目并取得學分。眾多的大學使得京都的科研事業也頗為發達，京都大學的桂校區已成為日本京都市的一大科研中心。也有眾多學會的總部設在京都，如日本人文地理學會等。日本京都的大學也頗為重視國際學術交流。

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