日本群島位于北太平洋西側,是太平洋西緣一系列弧形島嶼的一部分,包括北海道、本州、四國、九州四個大島和附近3000多小島組成。其中四個大島占日本總面積的 98%,以本州島為最大。因這些島嶼屬日本領土,故稱日本群島。日本群島的形成可以追溯到遠古時代,它與亞洲大陸原為一體,位于中國大陸東部邊緣地帶。后來由于環太平洋的造山運動,地殼連續不斷的發生劇烈變動,使日本與亞洲大陸分離。

日本本州島
本州島日本最大島嶼。東北-西南呈弧狀延伸,東北隔津輕海峽與北海道相對,西南隔周防灘和關門海峽與九州島為鄰,南隔瀨戶內海與四國島相望,西臨日本海,東瀕太平洋。長約1,287公里(800哩),寬度差別很大,最寬處約300千米。日本近3/4的縣分集中於此島,被視作日本的「大陸」。南部為日本早期歷史上的重要地區。太平洋沿岸為日本主要經濟中心和東京-橫濱、大阪-神戶都會區所在地。主島面積22.7萬平方千米,連同屬島面積約23萬平方千米,占全國面積的61.2%。人口約占全國人口的80%。海岸線長12,182公里(7,571哩)。
日本北海道島
北海道島,北海道(Hokkaido)位于日本群島最北部(北緯40度33分至45度33分,東經139度20分至148度53分之間)。南北寬420公里,東西長540公里,面積83,520㎞2(32,247平方哩),與鄰近小島構成行政單位「道」,占全日本陸地面積的21%。西臨日本海,南瀕太平洋,東北濱鄂霍次克海;西南以津輕海峽與本州毗鄰,北隔拉彼魯茲海峽(宗谷海峽)同俄國庫頁島(薩哈林島)相望,為扼控兩峽的戰略要地,日本北部邊防前哨,有“日本北門鎖鑰”之稱。以涼爽的氣候和近期形成的山脈、火山為地理特點。
日本九州島
九州島是日本第三大島。位于日本西南端,東北隔關門海峽與本州島相對,東隔豐予海峽和豐后水道與四國島相望,東南臨太平洋,西北隔朝鮮海峽與韓國為鄰,西隔黃海、東海與中國遙對。舊為筑前、筑后、豐前、豐后、肥前、肥后、日向、薩摩、大隅九國,遂稱九州。州在日語中為區域之意。主島面積3.65萬平方千米,連同所屬小島面積約4.34萬平方千米,僅次于本州和北海道,而比四國大。人口約1478萬人(2003年)。
日本四國島
四國島,日本第四大島。位于日本西南部。北臨瀨戶內海,南瀕太平洋,東隔鳴門海峽、紀伊水道與本州的近畿地方為鄰,西隔豐予海峽、豐后水道與九州相望。包括德島、香川、高知、愛媛4縣。面積18,806平方公里(7,261平方哩),連同屬島面積約1.9萬平方千米,人口約425萬。