日本對外使領館給予的簽證分為外交、公務、過境、觀光、商用及特定簽證6大類。按時間長短來劃分，簽證分為長期簽證和短期簽證兩種：居留期限在1年以下的為短期簽證，1年以上（最長為3年）的為長期簽證。長期簽證主要包括：留學簽證、學術交流簽證、教育傳授簽證、普通工作簽證、高級勞務簽證。

還有若干種類特殊簽證，如日本孤兒、日本人的中國配偶等，以及因公務的外交、新聞、貿易簽證等。按照日本入境管理法的規定，外國人有一定的專業特長的，日本允許他們在日本居留一定的時間，從事一定的工作。通常能夠獲得在日本長期居留的幾種簽證有：技術簽證、工作簽證、被撫養者簽證、特殊簽證等。